Gaussian是做计算化学必不可少的工具，包含Gaussian 09和GaussView 5。Gaussian 09是执行计算模块的地方，GaussView 5提供了可视化设计分子、设置计算参数、检验计算结果这些功能。目前用到的计算理论主要是DFT，其他的暂时没有接触。Gaussian 09这个软件的使用没有太多介绍的地方，它主要是执行计算的地方，理论部分得慢慢积累。输入文件是用GaussView生成，输出文件也一般用GaussView来进行可视化操作。关于Gaussian，网上有视频教学，今天主要是参考视频和GaussView自带的帮助文档学习的。
Introduction to GaussView
这个视频主要介绍了GaussView控制界面和视图界面的基本操作、常用按钮、计算参数的设置，还有如何画指定点阵的分子。时长6分多钟，比较简单。
Basic Molecule Building
这是GaussView自带的帮助文档里的几个案例学习，是基本的分子构建。
- Building Pyridine: Using Untyped Atoms：学习利用已有框架构建分子，会替换原子；
- Building Phenylpyridine: Setting the Angle Between Rings：学习二面角的调节，利用“Modify Dihedral”，选中四个原子，再进行角度的设置；
- Building Iron Pentacarbonyl: Selecting the Best Templates for a Given Task ：先选好大框架，再进行局部替换；
- Building Tyrian Purple Dye: Appending a Structure ：有重复单元的可以先画一个，再粘贴一个，最后修改一下连接键“Modify Bond”。
- Docking Two Structures: Building Bichloro-Diphenyl：同样是有两个重复单元，先不连接起来，按住Alt键，拖拽鼠标左键可以使一个单元旋转，最后再连接，得到想要的分子模型。 操作完之后点击“clean”，视图界面里的分子便会自动对齐。